Терапията с ударна вълна може да има определени странични ефекти. Терапията с ударна вълна обикновено използва силни въздушни вълни за постигане на терапевтични ефекти. По време на процеса на лечение може да доведе до увреждане на бъбреците, вторични камъни в уретера и дилатация на уретера. Някои пациенти могат също така да получат локално зачервяване на тъканите, подкожно кървене, синини, болка и други симптоми. Но по-голямата част от случаите са преходни и постепенно ще се подобрят след 1-2 дни лечение. Препоръчително е пациентите да не се тревожат много, да следват предписанията на лекаря, да получават своевременно лечение и да контролират състоянието си.